بخش اپیدمیولوژی و آمار زیستی از قدیمیترین بخشهای انستیتوپاستورایران می باشد که در سال 1325 شمسی توسط دکتر مارسل بالتازار، رییس وقت انستیتو پاستور تاسیس شد و ده ها سال به عنوان مرکزی منطقهای و بین المللی در رابطه با طاعون و تبهای راجعه با سازمان بهداشت جهانی همکاری داشت و تحقیقات وسیعی را در رابطه با اپیدمیولوژی بیماری های عفونی مختلف بالاخص تولارمی، هاری و آبله در ایران انجام داد. با توجه به رسالتی که برای انستیتو پاستور ایران در دیده بانی بیماری های عفونی کشور در نظر گرفته شده است و با توجه به کارهای انجام شده، بخش اپیدمیولوژی و آمار زیستی انستیتو پاستور ایران را میتوان پیشتاز تحقیقات اپیدمیولوژی میدانی و سیستم اطلاعات جغرافیایی(GIS) مرتبط با سلامت در کشور دانست، تحقیقاتی که در کشور تقریبا به فراموشی سپرده شده اند و هنوز هم لزوم انجام جدیتر آن ها در کشور احساس می شود.