بخش فيزيولوژي و فارماكولوژي در سال 1375 با الگوگيري از بخش علوم اعصاب انستيتو پاستور پاريس تاسيس گرديد.
فعاليتهاي عمده بخش:
· انجام پژوهش های بنیادی و کاربردی در عرصه علوم اعصاب
· طراحي و ارزيابي واكسن.
· طراحي و كشف مولكولهاي جديد دارويي با منشا گياهي و شيميايي.
· مطالعه و ارائه راهكارهاي جديد دارويي جهت مقابله با بروز مقاومت دارويي.
· تربیت دانشجویان کارشناسی ارشد و دکترای تخصصی
انجام بيش از 50 طرح پژوهشي، چاپ بيش از يكصد مقاله در مجلات معتبر پژوهشي و تربيت بيش از يكصد دانشجوي كارشناسي ارشد و دكترا نتيجه اين فعاليتها بوده است.
جهت گيري اخير بخش به سمت انجام پژوهش های بنیادی-کاربردی در زمينه بيماريهاي صعب العلاج و عفوني و استفاده از اين دانش در توسعه فراورده هاي دارويي و بيولوژيك مي باشد.