به‌منظور ارتقای نقش و تأثیرگذاری علمی–فنی انستیتو پاستور ایران در فرایند تصمیم‌سازی مربوط به کنترل و پیشگیری از بیماری‌های واگیر و غیرواگیر، و در پی تعامل مستمر با معاونت بهداشت وزارت بهداشت، تعدادی از اعضای هیأت علمی این انستیتو به عنوان عضو کمیته های فنی فعالیت می کنند. این اقدام تداوم مشارکت فعال و مؤثر محققان انستیتو پاستور ایران در سیاست‌گذاری‌ها و اقدامات عملیاتی حوزه سلامت عمومی کشور را نشان می‌دهد.
اسامی اعضای هیأت علمی انستیتو پاستور ایران در کمیته‌های فنی کشوری:
• کمیته فنی کشوری تشخیص پیش از تولد: دکتر مرتضی کریمی‌پور
• کمیته فنی هاری: دکتر مهدی فضلعلی‌پور
• کمیته فنی لیشمانیا: دکتر سیما رافتی و دکتر محمدرضا رضوی
• کمیته‌های فنی سیاه‌زخم، لپتوسپیروز و بیماری‌های منتقله از طریق آب و غذا: دکتر مهدی روحانی
• کمیته فنی تب‌های خونریزی‌دهنده ویروسی: دکتر محمدحسن پوریای ولی و دکتر مصطفی صالحی وزیری
• کمیته فنی مراقبت بیماری‌های واگیر: دکتر احسان مصطفوی، دکتر سنا عیب‌پوش و دکتر مصطفی صالحی وزیری
• کمیته فنی بیماری‌های منتقل‌شونده از طریق پشه آئدس: دکتر احسان مصطفوی و دکتر مصطفی صالحی وزیری
همچنین ریاست انستیتو پاستور ایران به‌عنوان عضو حقوقی کمیته ملی ایمن‌سازی در این ساختار ملی حضور دارد.
وظایف و مأموریت‌های اعضای کمیته‌های فنی ملی حوزه بهداشت با تکیه بر دانش تخصصی و تجربه عملی عبارتند از:
• ارائه مشاوره علمی و فنی به مقام‌های تصمیم‌گیر وزارت بهداشت در زمینه پیشگیری، تشخیص و کنترل بیماری‌ها
• تدوین، بازنگری و به‌روزرسانی دستورالعمل‌ها و راهکارهای بهداشتی مرتبط با تشخیص و کنترل بیماری‌ها
• تحلیل داده‌های اپیدمیولوژیک و انجام ارزیابی ریسک جهت راهنمایی برنامه‌های نظارتی و پاسخ به بحران‌های بهداشتی
• پشتیبانی آزمایشگاهی و تضمین کیفیت خدمات تشخیصی از طریق توسعه روش‌ها و استانداردها
• مشارکت در برنامه‌ریزی و اجرای دوره‌های آموزشی و توانمندسازی کارکنان حوزه بهداشت
انستیتو پاستور ایران با گسترش این همکاری‌ها در پی تقویت نقش راهبردی و علمی خود در نظام سلامت کشور و افزایش تأثیرگذاری توصیه‌ها و اقدامات فنی در چارچوب سیاست‌گذاری‌های ملی است.