چشم انداز (Vision)
مرکز تحقیقات بیماری های نوپدید و بازپدید برآن است که در طی دهه آینده به عنوان معتبرترین مرکز تحقیقاتی در حوزه بیماری های عفونی نوپدید و بازپدید و بیماری های عفونی فراموش شده در سطح منطقه مدیترانه شرقی، در تحقیقات و برنامه های کنترلی این دسته از بیماری ها در سطوح ملی و بین المللی نقش مهم خود را ایفا نماید.
رسالت (Mission)
مرکز تحقیقات بیماری های نوپدید و بازپدید، مجمعی علمی است که به منظور توسعه علوم و تحقیقات در حوزه بیماری های عفونی نوپدید و بازپدید و بیماری های عفونی فراموش شده به منظور ارائه راه حل در امور بهداشتی، کنترل این بیماریها و گسترش مرزهای دانش در سطوح ملی و بین المللی فعالیت می کند. این مرکز مطرح شدن به عنوان مرجع جهت تشخیص، طراحی و اجرای مطالعات بر روی بیماری های نوپدید و بازپدید در کشور و توسعه ارتباطات بین المللی را دنبال می کند.