اهم فعالیت‌های بخش در راستای خدمات تخصصی:
 
  • انجام تست‌های تشخیصی عامل عفونت مالاریا (پلاسمودیوم) در میزبان انسانی و ناقلین
  •  
  • فعالیت و مشارکت در ارزیابی برنامه‌های حذف بیماری با روش‌های مولکولی و سرولوژیک
  •  
  • تشخیص و پایش مولکولی مقاومت به داروهای ضد مالاریایی
  •  
  • تشخیص موارد بدون علامت مالاریا
  •  
  • تشخیص و تأیید گونه‌های آلوده‌کننده در موارد مشکوک و وارده از سایر کشورهای آندمیک مالاریا
  •  
  • شناسایی و ارزیابی آزمایشگاه‌های همکار در نقاط مختلف کشور با استفاده از ظرفیت‌های استقراریافته انستیتو پاستور ایران در زمینه سیستم تضمین کیفیت و ممیزی سیستم
  •  
  • مشارکت در امر آموزش آزمایشگاه‌های مراکز بهداشتی-درمانی و برگزاری دوره‌های آموزشی در قالب کارگاه‌های آموزشی، دوره‌های بازآموزی کوتاه‌مدت و میان‌مدت ملی، منطقه‌ای و میدانی
  •  
  • مشاوره با سایر مراکز همکار در زمینه حل مشکلات و بهینه‌سازی روش‌های تشخیصی و تحقیقی مرتبط
  •  
  • تهیه بسته‌های آموزشی در خصوص معرفی و بهینه‌سازی روش‌های تشخیصی موجود و نوین مالاریا با همکاری آزمایشگاه مرجع سلامت کشور و WHO
  •  
  • تهیه بسته‌های آموزشی در خصوص پیشگیری، تشخیص و درمان مالاریا با همکاری مرکز مدیریت مبارزه با بیماری‌های واگیر وزارت بهداشت
  •  
  • مشارکت فعال در اجرای برنامه ارزیابی خارجی کیفیت (EQAS)
  •  
  • مشارکت در ارزیابی کیت‌های تشخیصی تولیدشده و یا واردشده با همکاری معاونت غذا و دارو وزارت بهداشت و تحت نظر آزمایشگاه مرجع سلامت کشور
  •  
  •  مشارکت در تدوین و به‌روزرسانی دستورالعمل‌ها و استاندارد کشوری روش‌های تشخیص مالاریا با همکاری آزمایشگاه مرجع سلامت کشور و موسسه استاندارد.
  •  
  • مشارکت در برنامه‌های کشوری، منطقه‌ای و بین‌المللی غربالگری مالاریا با همکاری مرکز مدیریت مبارزه با بیماری‌های واگیر وزارت بهداشت
  •  
  • مشارکت فعال در حل بحران‌های احتمالی کشوری مرتبط با بیماری مالاریا تحت نظارت مرکز مدیریت مبارزه با بیماری‌های واگیر وزارت بهداشت
  •  
  • همکاری در اجرای برنامه‌های ممیزی داخلی و یا کشوری به درخواست آزمایشگاه مرجع سلامت کشور
  •  
  • همکاری در برگزاری سمینارهای کشوری و بین‌المللی مرتبط
  •  
  • گسترش همکاری با سایر مراکز علمی داخل و خارج از کشور در قالب عقد تفاهم‌نامه‌های فی‌مابین.
  •  
  • همکاری و پشتیبانی در راه‌اندازی آزمایشگاه‌های مرجع منطقه‌ای و دانشگاهی  و تقویت توانمندی شبکه تشخیص آزمایشگاهی در زمینه تشخیص عفونت مالاریا
  •  
  • همکاری در تدوین چک‌لیست تخصصی اعتباربخشی آزمایشگاه‌های مرجع منطقه‌ای 
  •  
  • همکاری در انجام طرح‌های تحقیقاتی کاربردی و استراتژیک در زمینه کنترل عفونت مالاریا کشور پس از تصویب در کمیته فنی کشوری مبارزه با مالاریا 
  •  
اهم فعالیت‌های بخش در راستای تولید فرآورده:
 
  1. پروژه ملی لارودرمانی با بودجه وزارت بهداشت
  2. پروژه کلان کیت مولکولی تشخیص مقاومت به سموم آفت‌کش با بودجه صندوق فناوری تهران
  3. پروژه توسعه و تولید واکسن‌های ممانعت کننده از انتقال با حمایت مرکز مدیریت بیماری‌ها، انستیتو پاستور ایران و سازمان جهانی بهداشت
  4. پروژه پرورش و به‌کارگیری زالو در درمان بیماری‌ها